Search for Common Molecular Genetic Markers of Nosocomial Pneumonia and Acute Respiratory Distress Syndrome
General Reanimatology
View Archive InfoField | Value | |
Title |
Search for Common Molecular Genetic Markers of Nosocomial Pneumonia and Acute Respiratory Distress Syndrome
МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МАРКЕРЫ НОЗОКОМИАЛЬНОЙ ПНЕВМОНИИИ ОСТРОГО РЕСПИРАТОРНОГО ДИСТРЕСС-СИНДРОМА |
|
Creator |
T. Smelaya V.; V. A. Negovsky Research Institute of General Reanimatology, Moscow
A. Kuzovlev N.; V. A. Negovsky Research Institute of General Reanimatology, Moscow V. Moroz V.; V. A. Negovsky Research Institute of General Reanimatology, Moscow A. Golubev M.; V. A. Negovsky Research Institute of General Reanimatology, Moscow O. Belopolskaya B.; V. N. Vavilov Institute of General Genetics, Moscow L. Salnikova E.; V. A. Negovsky Research Institute of General Reanimatology, Moscow V. N. Vavilov Institute of General Genetics, Moscow Т. Смелая В.; НИИ общей реаниматологии им. В. А. Неговского, Москва А. Кузовлев Н.; НИИ общей реаниматологии им. В. А. Неговского, Москва В. Мороз В.; НИИ общей реаниматологии им. В. А. Неговского, Москва А. Голубев М.; НИИ общей реаниматологии им. В. А. Неговского, Москва О. Белопольская Б.; Институт общей генетики им. Н. И. Вавилова, Москва Л. Сальникова Е.; НИИ общей реаниматологии им. В. А. Неговского, Москва Институт общей генетики им. Н. И. Вавилова, Москва |
|
Subject |
gene polymorphism; oxidative stress genes; xenobiotic detoxification genes; acute respiratory distress syndrome; nosocomial pneumonia
полиморфизм генов; гены оксидативного стресса; гены детоксикации ксенобиотиков; острый респираторный дистресс-синдром; нозокомиальная пневмония |
|
Description |
Genetic predisposition partially accounts for the clinical variability of the course of an infectious process. A total of 750 people, including 419 (81.1%) male patients aged 42.9±0.9 years, admitted to the clinics of the V. A. Negovsky Research Institute of General Reanimatology (Moscow, Russia), were genotyped to establish the influence of genetic factors on their susceptibility to critical conditions.Materials and methods. Tetra-primer allele-specific polymerase chain reaction was used to investigate single-nucleotide polymorphisms (SNP) in the xenobiotic detoxification and oxidative stress genes (CYP1A1 (three sites), AhR, ABCB1, SOD2, GCLC and CAT) and in the vascular homeostasis genes (ACE, AGT, AGTR1, NOS3, VEGFα and MTHFR).Results. A total of 268 nosocomial pneumonia (NP) cases were registered in a patient group. Individual SNP analysis has shown that among the patients with NP the risk of acute respiratory distress syndrome (ARDS) is associated with the carriage of the following genotypes: CYP1A1 rs2606345-Т/Т (p=0.0027, OR=2.38; 95% CI: 1.35—4.17) and AhRrs2066853-G/A-A/A (p=0.0012, OR=2.94; 95% CI: 1.54—5.60). The frequency of the C allele of the AGTR1 gene (re5186) was much higher among the survivors (in the NP group). The assessment of a multiplicative genetic model of genes that had demonstrated the highest single-locus effects because of a ARDS risk, as well as in-hospital mortality, could establish the complex genotype including a combination of risky alleles of the detoxi- fication and vascular homeostasis genes (CYP1A1 rs2606345-T — AhR rs2066853-A and ACE rs4340-D — AGT rs699-C — AGTR1 rs5186-C), which was associated with the increased risk of both NP and ARDS, as well as with the likelihood of a fatal outcome.Conclusion. An understanding of the risk factors of NP and ARDS will aid in predicting the outcome of the underlying disease and in developing possible preventive measures.
Риск развития, особенности течения нозокомиальной пневмонии (НП) и острого респираторного дистресс-синдрома (ОРДС) зависит не только от свойств возбудителя, но и от генетических особенностей больного. Известен значительный вклад генетических факторов в предрасположенность, особенности течения и исхода при инфекционных осложнениях критических состояний. Цель данного исследования — выявление генотипов, сопряженных с риском развития НП и ОРДС.Материалы и методы. Были изучены однонуклеотидные полиморфные варианты (SNPs) в генах детоксикации ксенобиотиков и оксидативного стресса (CYP1A1 (три сайта), AhR, ABCB1, SOD2, GCLC, CAT), а также в генах сосудистого гомеостаза (ACE, AGT, AGTR1, NOS3, VEGFα и MTHFR) с помощью тетра-праймерной аллельспецифической полимеразной цепной реакции (ПЦР). Были генотипированы 750 человек: 419 больных и пострадавших (81,1% мужчин, в возрасте 42.9±0,9 года), госпитализированных в клинические базы НИИ общей реаниматологии им. В. А. Неговского (Москва, Россия).Результаты. В группе больных зарегистрированы 268 случаев НП. Индивидуальный SNPs анализ показал, что среди больных НП риск развития ОРДС сопряжен с носительством следующих генотипов: CYP1A1 rs2606345-Т/Т (p=0,0027, OR=2,38, 95% CI: 1,35—4,17) и AhR rs2066853-G/A-A/A (p=0,0012, OR=2,94, 95% CI: 1,54—5,60). Частота встречаемости С-аллеля гена AGTR1 rs5186 была значительно выше среди выживших (в группе НП). Оценка мультипликативной генетической модели генов, которые продемонстрировали наибольшие однолокусные эффекты в связи с риском развития ОРДС, и госпитальной летальности, позволила установить комплексный генотип, включающий сочетание рисковых аллелей генов системы детоксикации и сосудистого гомеостаза (CYP1A1 rs2606345-T — AhR rs2066853-A и ACE rs4340-D — AGT rs699-C — AGTR1 rs5186-C), ассоциированный с повышенным риском развития как НП, так и ОРДС, а также с вероятностью летального исхода.Вывод. Ряд аллельных вариантов генов детоксикации ксенобиотиков сопряжен с риском развития нозокомиальной пневмонии и ОРДС: CYP1A1 rs2606345-Т/Т, AhRrs2066853 G/A-A/A и AGT rs699 C/C AhR rs2066853-G/A-A/A. Сочетание двух и более рисковых аллелей в генах CYP1A1, AhR, ACE, AGT и AGTR1 у одного и того же больного повышает риск развития НП. Увеличение количества рисковых аллелей до четырех и более у больных НП сопряжено с риском развития ОРДС. |
|
Publisher |
FSBI "SRIGR" RAMS
|
|
Contributor |
—
— |
|
Date |
2015-07-07
|
|
Type |
info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion Рецензированная статья |
|
Format |
application/pdf
application/pdf |
|
Identifier |
http://www.reanimatology.com/rmt/article/view/1462
10.15360/1813-9779-2015-3-24-38 |
|
Source |
General Reanimatology; Том 11, № 3 (2015); 24-38
Общая реаниматология; Том 11, № 3 (2015); 24-38 2411-7110 1813-9779 10.15360/1813-9779-2015-3 |
|
Language |
rus
eng |
|
Relation |
http://www.reanimatology.com/rmt/article/view/1462/922
http://www.reanimatology.com/rmt/article/view/1462/984 |
|
Rights |
Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication, with the work 6 month after publication simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.
Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (См. The Effect of Open Access). |
|