VIRTUAL SCREENING OF NOVEL ANTI-HIV AGENTS, PEPTIDOMIMETICS OF MONOCLONAL ANTIBODY VRC01 EXHIBITING BROAD VIRAL NEUTRALIZATION
Doklady of the National Academy of Sciences of Belarus
View Archive Info| Field | Value | |
| Title |
VIRTUAL SCREENING OF NOVEL ANTI-HIV AGENTS, PEPTIDOMIMETICS OF MONOCLONAL ANTIBODY VRC01 EXHIBITING BROAD VIRAL NEUTRALIZATION
ВИРТУАЛЬНЫЙ СКРИНИНГ НОВЫХ АНТИ-ВИЧ АГЕНТОВ – ПЕПТИДОМИМЕТИКОВ МОНОКЛОНАЛЬНОГО АНТИТЕЛА VRC01, ПРОЯВЛЯЮЩЕГО ШИРОКУЮ ВИРУСНУЮ НЕЙТРАЛИЗАЦИЮ |
|
| Creator |
I. KASHYN A.
A. TUZIKOV V. A. ANDRIANOV M. И. КАШИН А.; Институт биоорганической химии НАН Беларуси, Минск А. ТУЗИКОВ В.; Объединенный институт проблем информатики НАН Беларуси, Минск А. АНДРИАНОВ М.; Институт биоорганической химии НАН Беларуси, Минск |
|
| Subject |
—
— |
|
| Description |
Based on the analysis of the structural complex between neutralizing antibody VRC01 and the HIV-1 gp120 protein, the virtual screening of chemical compounds able to mimic pharmacophore properties of the immunoglobulin antigen-binding site was carried out. Using the molecular modeling, the complexes of these compounds with gp120 were built and the evaluation of their potential inhibitory activity was performed followed by the calculation of free energy of formation of supramolecular structures. As a result, top-six compounds, which specifically and effectively interact with amino acid residues of gp120 critical for its binding to the primary receptor CD4 of target cell, were selected. In the light of the findings obtained, the identified compounds are considered as promising basic structures for the design of novel anti-HIV drugs with broad viral neutralization.
На основе анализа структурного комплекса нейтрализующего антитела VRC01 с белком gp120 ВИЧ-1 осуществлен виртуальный скрининг химических соединений, способных имитировать фармакофорные свойства антиген-связывающего центра иммуноглобулина. Методами молекулярного моделирования построены комплексы этих соединений с белком gp120, проведена оценка их потенциальной ингибирующей активности и рассчитаны свободные энергии образования надмолекулярных структур. В результате отобраны шесть соединений-лидеров, специфически и эффективно взаимодействующих с аминокислотными остатками белка gp120, критическими для его связывания с первичным рецептором CD4 клетки-мишени. Исходя из полученных данных, идентифицированные соединения рассматриваются как перспективные базовые структуры для создания новых лекарственных препаратов против ВИЧ с широким спектром нейтрализующего действия. |
|
| Publisher |
The Republican Unitary Enterprise Publishing House "Belaruskaya Navuka"
|
|
| Contributor |
—
— |
|
| Date |
2016-06-09
|
|
| Type |
info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion — — |
|
| Format |
application/pdf
|
|
| Identifier |
http://doklady.belnauka.by/jour/article/view/205
|
|
| Source |
Doklady of the National Academy of Sciences of Belarus; Том 58, № 2 (2014); 63-72
Доклады Национальной академии наук Беларуси; Том 58, № 2 (2014); 63-72 0002-354X |
|
| Language |
rus
|
|
| Relation |
http://doklady.belnauka.by/jour/article/view/205/207
|
|
| Rights |
Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access).
Авторы, публикующие в данном журнале, соглашаются со следующим:Авторы сохраняют за собой авторские права на работу и предоставляют журналу право первой публикации работы на условиях лицензии Creative Commons Attribution License, которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы сохраняют право заключать отдельные контрактные договорённости, касающиеся не-эксклюзивного распространения версии работы в опубликованном здесь виде (например, размещение ее в институтском хранилище, публикацию в книге), со ссылкой на ее оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (См. The Effect of Open Access). |
|