Record Details

HEPATITIS C VIRUS INTERGENOTYPIC RECOMBINANTS: THE NATURAL MODEL FOR STUDYING MOLECULAR GENETIC DETERMINANTS OF VIRAL RESISTANCE TO ANTIVIRAL DRUGS

Translational Medicine

View Archive Info
 
 
Field Value
 
Title HEPATITIS C VIRUS INTERGENOTYPIC RECOMBINANTS: THE NATURAL MODEL FOR STUDYING MOLECULAR GENETIC DETERMINANTS OF VIRAL RESISTANCE TO ANTIVIRAL DRUGS
Межгенотипные рекомбинанты вируса гепатита с - природные модели для изучения молекулярно-генетических детерминант резистентности вируса к действию противовирусных препаратов
 
Creator O. Kalinina V.; Saint-Petersburg Pasteur Epidemiology and Microbiology Research Institute
K. Dudina R.; Moscow State University of Medicine and Dentistry
A. Kozina N.; Moscow State University of Medicine and Dentistry
A. Dmitriev V.; Research Institute of Experimental Medicine of the NorthWest Branch of the Russian Academy of Medical Sciences
M. Isaguliants G.; Ivanovskiy Research Institute of Virology
O. Znoiko O.; Moscow State University of Medicine and Dentistry
Ольга Калинина Викторовна; ФБУН «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера» Роспотребнадзора
Кристина Дудина Рубеновна; ГБОУ ВПО «Московский государственный медико-стоматологический университет им. А.И. Евдокимова» Минздрава России
Анастасия Козина Николаевна; ГБОУ ВПО «Московский государственный медико-стоматологический университет им. А.И. Евдокимова» Минздрава России
Александр Дмитриев Валентинович; ФГБУ «Научно-исследовательский институт экспериментальной медицины» СЗО РАМН
Мария Исагулянц Георгиевна; ФГБУ «Научно-исследовательский институт вирусологии им. Д.И. Ивановского» Минздрава России
Ольга Знойко Олеговна; ГБОУ ВПО «Московский государственный медико-стоматологический университет им. А.И. Евдокимова» Минздрава России
 
Subject межгенотипные рекомбинанты вируса гепатита С; геном; противовирусная терапия; Hepatitis C virus intergenotypic recombinants; genome; antiviral therapy
 
Description Review presents the current data on the genome organization of the hepatitis C virus intergenotypic recombinants, the peculiarities of genetic determinants potentially involved in the interferon resistant phenotype, summarizes the antiviral therapy outcomes for patients infected by hepatitis C virus recombinants.
В работе представлены данные об организации генома межгенотипных рекомбинантов вируса гепатита С, описаны отличительные особенности генетических детерминант, потенциально вовлеченных в формирование резистентности к действию интерферона, обобщены результаты лечения пациентов, инфицированных рекомбинантными формами вируса гепатита С.
 
Publisher Federal Almazov North-West Medical Research Centre, Saint Petersburg, Russia
 
Date 2016-12-23
 
Type info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
—
 
Format application/pdf
 
Identifier http://transmed.almazovcentre.ru/jour/article/view/34
 
Source Translational Medicine; № 3 (2014); 29-38
Трансляционная медицина; № 3 (2014); 29-38
2410-5155
2311-4495
 
Language rus
 
Relation http://transmed.almazovcentre.ru/jour/article/view/34/35
Choo Q.L., Richman K.H., Han J.H. et al. Genetic organization and diversity of the hepatitis C virus // Proc. Natl. Acad. Ssi. USA. - 1991. - Vol. 88, № 6. - P. 2451-2455.
Lindenbach B.D., Rice C.M. Unrevalling hepatitis C virus replication from genome to function // Nature. - 2005. - Vol. 436, № 7053. - P. 933-938.
World Health Organization. Hepatitis C. Fact sheet. - 2012. - № 164. / [Электронный ресурс]. URL: http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs164/en/
Вирусные гепатиты в Российской Федерации / под ред. Онищенко Г.Г., Жебруна А.Б. - СПб: НИИЭМ им. Пастера, 2010 - 204 с.
Simmonds P. Viral heterogeneity of the hepatitis C virus // J. Hepatol. - 1999. - Vol. 31, Suppl. 1. - P. 54-60.
Kalinina O., Norder H., Mukomolov S., Magnius L.O. A natural intergenotypic recombinant of hepatitis C virus identified in St. Petersburg // J. Virol. - 2002. - Vol. 76, № 8. - P. 4034-4043.
Kalinina O., Norder H., Magnius L.O. Full-Length Open Reading Frame of a Recombinant hepatitis C Virus Strain from St. Petersburg: Proposed mechanism for its formation // J. Gen. Virol. - 2004. - Vol. 85, № 7. - P. 1853-1857.
Smith D.B., Bukh J., Kuiken C. et al. Expanded classification of hepatitis C virus into 7 genotypes and 67 subtypes : updated criteria and genotype assignment WEB resource // Hepatology. - 2014. - Vol. 59, № 1. - P. 318-327.
Ющук Н.Д., Климова Е.А., Знойко О.О. и др. Протокол диагностики и лечения больных вирусными гепатитами В и С // Росс. Журнал. Гас. Гепат. Колопрокт. - 2010. - Vol. 20, № 6. - С. 4-60.
Bhattacharya D., Accola M.A., Ansari I.H. et al. Naturally occurring genotype 2b/1a hepatitis C virus in the United States // Virol. J. - 2011. - Vol. 8, № 458. / [Электронный ресурс]. doi:10.1186/1743-422X-8-458
Lee Y.M., Lin H.J., Chen Y.J. et al. Molecular epidemiology of HCV genotypes among injection drug users in Taiwan: Full-length sequences of two new subtype 6w strains and a recombinant form_2b/6w // J. Med. Virol. - 2009. - Vol. 82, № 1. - P. 57-68.
Legrand-Abravanel F., Claudinon J., Nicot F. et al. New natural intergenotypic (2/5) recombinant of hepatitis C virus // J. Virol. - 2007. - Vol. 81, № 8. - P. 4357-4362.
Noppornpanth S., Lien T.X., Poovorawan Y. et al. Identification of a Naturally Occurring Recombinant Genotype 2/6 Hepatitis C Virus // J. Virol. - 2006. - Vol. 80, № 15. - P. 7569-7577.
Kageyama S., Agdamag D.M., Alesna E.T. et al. A natural inter-genotypic (2b/1b) recombinant of hepatitis C virus in the Philippines // J. Med. Virol. - 2006. - Vol. 78, № 11. - P. 1423-1428.
Yokoyama K., Takahashi M., Nishizawa T. et al. Identification and characterization of a natural inter-genotypic (2b/1b) recombinant hepatitis C virus in Japan // Arch. Virol. J. - 2011. - Vol. 156. - P. 1591-1601.
Hoshino H., Hino K., Miyakawa H., Takahashi K. Inter-genotypic recombinant hepatitis C virus strains in Japan noted by discrepancies between immunoassay and sequencing // J. Med. Virol. - 2012. - Vol. 1024. - P. 1018-1024.
Spahn C.M., Kieft J.S., Grassucci R.A. et al. Hepatitis C virus IRES RNA-induced changes in the conformation of the 40s ribosomal subunit // Science. - 2001. - Vol. 291, № 5510. - 1959-1962.
Collier A.J., Tang S., Elliott R.M. Translation efficiencies of the 5’ untranslated region from representatives of the six major genotypes of hepatitis C virus using a novel bicistronic reporter assay system // J. Gen. Virol. - 1998. Vol. 79, № 10. - P. 2359-2366.
Kolykhalov A.A., Mihalik K., Feinstone S.M., Rice C.M. Hepatitis C virus-encoded enzymatic activities and conserved RNA elements in the 3’ nontranslated region are essential for virus replication in vivo // J. Virol. - 2000. - Vol. 74, № 4. - P. 2046-2051.
Lu W., Lo S.Y., Chen M. et al. Activation of p53 tumor suppressor by hepatitis C virus core protein // Virology. - 1999. - Vol. 264, № 1. - P. 134-141.
Yoshida T., Hanada T., Tokuhisa T. et al. Activation of STAT3 by the hepatitis C virus core protein leads to cellular transformation // J. Exp. Med. - 2002. - Vol. 196, № 5. - P. 641-653.
Tsutsumi T., Suzuki T., Moriya K. et al. Hepatitis C virus core protein activates ERK and p38 MAPK in cooperation with ethanol in transgenic mice // Hepatology. - 2003. - Vol. 38, № 4. - P. 820-828.
Roohvand F., Maillard P., Lavergne J.P. et al. Initiation of hepatitis C virus infection requires the dynamic microtubule network: role of the viral nucleocapsid protein // J. Biol. Chem. - 2009. - Vol. 284, № 20. - P. 13778-13791.
Miyanari Y., Atsuzawa K., Usuda N. et al. The lipid droplet is an important organelle for hepatitis C virus production // Nat. Cell Biol. - 2007. - Vol. 9, № 9. - P. 1089-1097.
Miyoshi H., Fujie H., Shintani Y. et al. Hepatitis C virus core protein exerts an inhibitory effect on suppressor of cytokine signaling (SOCS)-1 gene expression // J. Hepatol. - 2005. - Vol. 43, № 5. - P. 757-763.
Vassilaki N., Mavromara P. Two alternative translation mechanisms are responsible for the expression of the HCV ARFP/F/core+1 coding open reading frame // J. Biol. Chem. - 2003. - Vol. 278, № 42. - P. 40503-40513.
Dalagiorgou G., Vassilaki N., Foka P. et al. High levels of HCV core+1 antibodies in HCV patients with hepatocellular carcinoma // J. Gen. Virol. - 2011. - Vol. 92, № 6. - P. 1343-1351.
Cormier E., Durso R.J., Tsamis F. et al. L-SIGN (CD209L) and DC-SIGN (CD209) mediate transinfection of liver cells by hepatitis C virus // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2004. - Vol. 101, № 39. - P. 14067-14072.
Evans M.J., von Hahn T., Tscherne D.M. et al. Claudin-1 is a hepatitis C virus co-receptor required for a late step in entry // Nature. - 2007. - Vol. 446, № 7137. - P. 801-805.
Ploss A., Evans M.J., Gaysinskaya VA. et al. Human occludin is a hepatitis C virus entry factor required for infection of mouse cells // Nature. - 2009. - Vol. 457, № 7231. - P. 882-886.
Pileri P., Uematsu Y., Campagnoli S. et al. Binding of hepatitis C virus to CD81 // Science. - 1998. - Vol. 282, № 5390. - P. 938-941.
Heo T.H., Lee S.M., Bartosch B. et al. Hepatitis C virus E2 links soluble human CD81 and SR-B1 protein // Virus Res. - 2006. - Vol. 121, № 1. - P. 58-64.
Taylor D.R., Shi S.T., Romano P.R. et al. Inhibition of the interferon-inducible protein kinase PKR by HCV E2 protein // Science. - 1999. - Vol. 285, № 5424. - P. 107-110.
Steinmann E., Pietschmann T. Hepatitis C virus p7-a viroporin crucial for virus assembly and an emerging target for antiviral therapy // Viruses. - 2010. - Vol. 2, № 9. - P. 2078-2095.
Yi M., Ma Y., Yates J., Lemon S.M. Compensatory mutations in E1, p7, NS2, and NS3 enhance yields of cell culture-infectious intergenotypic chimeric hepatitis C virus // J. Virol. - 2007. - Vol. 81, № 2. - P. 629-638.
Moradpour D., Penin F., Rice C.M. Replication of hepatitis C virus // Nat. Rev. Microbiol. - 2007. - Vol. 5, № 6. - P. 453-463.
Meylan E., Curran J., Hofmann K. et al. Cardif is an adaptor protein in the RIG-I antiviral pathway and is targeted by hepatitis C virus // Nature. - 2005. - Vol. 437, № 7062. - P. 1167-1172.
Li Y., Zhang Q., Liu Y. et al. Hepatitis C virus activates Bcl-2 and MMP-2 expression through multiple cellular signaling pathways // J. Virol. - 2012. - Vol. 86, № 23. - P. 12531-12543.
Nitta S., Sakamoto N., Nakagawa M. et al. Hepatitis C virus NS4B protein targets STING and abrogates RIGI-mediated type-I interferon-dependent innate immunity // Hepatology. - 2013. - Vol. 57, № 1. - P. 46-58.
Gale M.Jr., Blakely C.M., Kwieciszewski B. et al. Control of PKR proteinkinase by hepatitis C virus non-structural 5A protein: molecular mechanisms of kinase regulation // Mol. Cell Biol. - 1998. - Vol. 18, № 9. - P. 5208-5218.
Enomoto N., Sakuma I., Asahina Y. et al. Mutations in the nonstructural protein 5A gene and response to interferon in patients with chronic hepatitis C virus 1b infection // New Eng. J. Med. - 1996. - Vol. 334, № 2. - P. 77-81.
Kumthip K., Pantip C., Chusri P. et al. Correlation between mutations in the core and NS5A genes of hepatitis C virus genotypes 1a, 1b, 3a, 3b, 6f and the response to pegylated interferon and ribavirin combination therapy // J. Viral. Hepat. - 2011. - Vol. 18, № 4. - P. 117-125.
Bouzgarrou N., Hassen E., Mahfoudh W. et al. NS5A (ISDR-V3) region genetic variability of Tunisian HCV-1b strains: Correlation with the response to the combined interferon/ribavirin therapy // J. Med. Virol. - 2009. - Vol. 81, № 12. - P. 2021-2028.
Bressanelli S., Tomei L., Roussel A. et al. Crystal structure of the RNA-dependent RNA polymerase of hepatitis C virus // PNAS. - 1999. - Vol. 96, № 23. - P. 13034-13039.
Luo G., Hamatake R.K., Mathis D.M. et al. De novo initiation of RNA synthesis by the RNA-dependent RNA polymerase (NS5B) of hepatitis C virus // J. Virol. - 2000. - Vol. 74, № 2. - P. 851-863.
Ranjith-Kumar C.T., Gutshall L., Kim M.J et al. Requirements for de novo initiation of RNA synthesis by recombinant flaviviral RNA-dependent RNA polymerases // J. Virol. - 2002. - Vol. 76, № 24. - P. 12526-12536.
Watashi K., Ishii N., Hijikata M. et al. Cyclophilin B is a functional regulator of hepatitis C virus RNA polymerase // Mol. Cell. - 2005. - Vol. 19, № 1. - P. 111-122.
Знойко О.О. Клинико-патогенетические особенности естественного течения вирусного гепатита С и оптимизация лабораторно-диагностических критериев исходов заболевания: автореф. дис.. докт. мед. наук. - М., 2007. - 44 с.
Morel V., Descamps V., François C. et al. Emergence of a genomic variant of the recombinant 2k/1b strain during a mixed hepatitis C infection: a case report // J. Clin. Virol. - 2010. - Vol. 47, № 4. - P. 382-386.
 
Rights Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access).
Авторы, публикующие в данном журнале, соглашаются со следующим:Авторы сохраняют за собой авторские права на работу и предоставляют журналу право первой публикации работы на условиях лицензии Creative Commons Attribution License, которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы сохраняют право заключать отдельные контрактные договорённости, касающиеся не-эксклюзивного распространения версии работы в опубликованном здесь виде (например, размещение ее в институтском хранилище, публикацию в книге), со ссылкой на ее оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (См. The Effect of Open Access).