Record Details

DANON DISEASE DIAGNOSIS BY TARGETED NEXT-GENERATION SEQUENCING: IDENTIFICATION OF LAMP2 MUTATIONS

Doklady of the National Academy of Sciences of Belarus

View Archive Info
 
 
Field Value
 
Title DANON DISEASE DIAGNOSIS BY TARGETED NEXT-GENERATION SEQUENCING: IDENTIFICATION OF LAMP2 MUTATIONS
ДИАГНОСТИКА БОЛЕЗНИ ДАНОНА МЕТОДОМ TARGETED NEXT-GENERATION SEQUENCING: ИДЕНТИФИКАЦИЯ МУТАЦИИ В ГЕНЕ LAMP2
 
Creator L. Sivitskaya N.; Institute of Genetics and Cytology of the National Academy of Sciences of Belarus
N. Danilenko G.; Institute of Genetics and Cytology of the National Academy of Sciences of Belarus
T. Vaikhanskaya G.; Republican Scientific and Practical Center of Cardiology
A. Liaudanski D.; Institute of Genetics and Cytology of the National Academy of Sciences of Belarus
O. Davydenko G.; Institute of Genetics and Cytology of the National Academy of Sciences of Belarus
Л. Сивицкая Н.; Институт генетики и цитологии Национальной академии наук Беларуси
Н. Даниленко Г.; Институт генетики и цитологии Национальной академии наук Беларуси
Т. Вайханская Г.; Республиканский научно-практический центр «Кардиология»
О. Левданский Д.; Институт генетики и цитологии Национальной академии наук Беларуси
О. Давыденко Г.; Институт генетики и цитологии Национальной академии наук Беларуси
 
Subject Danon disease; cardiomyopathy; LAMP2 gene; Next-Generation Sequencing; splicing mutation; DNA diagnostics
болезнь Данона; кардиомиопатия; ген LAMP2; Next-Generation Sequencing; сплайсинг-мутация; ДНК-диагностика
 
Description The case report of the Danon disease firstly diagnosed in Belarus is presented. The targeted Next-Generation Sequencing (tNGS) was used to search for mutations in 46 genes associated with cardiomyopathy of different genesis in a patient suffered from dilated cardiomyopathy, peripheral muscle disorders and mild dementia. Hemizygous deletion c.864+3_864+6delGAGT (rs397516751, NM_002294.2) in the LAMP2 gene affecting the natural splice site was detected. The LAMP2 gene (Lysosomal Associated Membrane Protein 2, Xq24) encodes a membrane glycoprotein essential for the adhesion of lysosomes. Mutations in LAMP2 lead to the distortion of the autophagy by lysosomes and glycogen accumulation in the cells. Clinically, they manifest in the Danon disease: hypertrophic or dilated cardiomyopathy, skeletal myopathy, and mental retardation. The metabolic reason of cardiomyopathy has not been recognized in the present case. The tNGS has allowed one to correct the diagnosis. The early exact diagnosis for such patients is essential to slow down the disease progression. The Danon disease can proceed asymptomatically before puberty and then develops rapidly with sudden mortality. 
В сообщении представлен клинический случай болезни Данона, впервые диагностированной в Беларуси. Метод targeted Next-Generation Sequencing (tNGS) был применен для поиска изменений в 46 генах, ассоциированных с развитием кардиомиопатий различного генеза, у пациента с дилатационной кардиомиопатией. Сопутствующими клиническими проявлениями были периферические мышечные нарушения и умеренная деменция. Выявлена гемизиготная делеция с.864+3_864+6delGAGT (rs397516751, NM_002294.2) в гене LAMP2, затрагивающая естественный сайт сплайсинга. Ген LAMP2 (Lysosomal Associated Membrane Protein 2, Xq24) кодирует мембранный гликопротеид, необходимый для адгезии лизосом. Мутации в нем приводят к накоплению гликогена в клетках вследствие нарушения процесса аутофагии лизосомами. Клинически они проявляются болезнью Данона: гипертрофическая или дилатационная кардиомиопатия, скелетная миопатия и умственная отсталость. В представленном клиническом случае метаболическая причина кардиомиопатии была не распознана. Метод tNGS позволил скорректировать диагноз. Очевидна необходимость наиболее ранней постановки правильного диагноза у таких пациентов для своевременного принятия мер, направленных на замедление прогрессирования заболевания. Болезнь Данона может протекать бессимптомно до пубертатного возраста, далее происходит стремительное развитие и прогрессирование признаков с высокой смертностью, возникающей внезапно.
 
Publisher The Republican Unitary Enterprise Publishing House "Belaruskaya Navuka"
 
Contributor —
—
 
Date 2017-08-15
 
Type info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
—
—
 
Format application/pdf
 
Identifier http://doklady.belnauka.by/jour/article/view/423
 
Source Doklady of the National Academy of Sciences of Belarus; Том 61, № 3 (2017); 64-72
Доклады Национальной академии наук Беларуси; Том 61, № 3 (2017); 64-72
1561-8323
 
Language rus
 
Relation http://doklady.belnauka.by/jour/article/view/423/424
Danon’s disease as a cause of hypertrophic cardiomyopathy: a systematic survey / P. Charron [et al.] // Heart. – 2004. – Vol. 90, N 8. – P. 842–846. doi.org/10.1136/hrt.2003.029504
Boucek, D. Natural history of Danon disease / D. Boucek, J. Jirikowic, M. Taylor // Genet. Med. – 2011. – Vol. 13, N 6. – P. 563–568. doi.org/10.1097/gim.0b013e31820ad795
Lysosomal glycogen storage disease with normal acid maltase / M. J. Danon [et al.] // Neurology. – 1981. – Vol. 31, N 1. – P. 51–57. doi.org/10.1212/wnl.31.1.51
Accumulation of autophagic vacuoles and cardiomyopathy in LAMP-2-deficient mice / Y. Tanaka [et al.] // Nature. – 2000. – Vol. 406, N 6798. – P. 902–906. doi.org/10.1038/35022595
Clinicopathological features of genetically confirmed Danon disease / K. Sugie [et al.] // Neurology. – 2002. – Vol. 58, N 12. – P. 1773–1778. doi.org/10.1212/wnl.58.12.1773
Clinical Outcome and Phenotypic Expression in LANP2 Cardiomyopathy / B. J. Maron [et al.] // JAMA. – 2009. – Vol. 301, N 12. – P. 1253–1259. doi.org/10.1001/jama.2009.371
Primary LAMP-2 deficiency causes X-linked vacuolar cardiomyopathy and myopathy (Danon disease) / I. Nishino [et al.] // Nature. – 2000. – Vol. 406, N 6798. – P. 906–910. doi.org/10.1038/35022604
A novel LAMP2 mutation associated with severe cardiac hypertrophy and microvascular remodeling in a female with Danon disease: a case report and literature review / I. Bottillo [et al.] // Cardiovasc. Pathol. – 2016. – Vol. 25, N 5. – P. 423–431. doi.org/10.1016/j.carpath.2016.07.005
NCBI/Primer-BLAST [Electronic resource]. – Mode of access: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast. – Date of access: 15.12.2016.
FASTQC [Electronic resource]. – Mode of access: http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/. – Date of access: 20.01.2017.
IGV [Electronic resource]. – Mode of access: http://software.broadinstitute.org/software/igv/home. – Date of access: 20.01.2017.
BWA [Electronic resource]. – Mode of access: https://sourceforge.net/projects/bio-bwa/. – Date of access: 21.01.2017.
SAMtool v.1.18 [Electronic resource]. – Mode of access: http://samtools.sourceforge.net/. – Date of access: 22.01.2017.
GATK v3.2/2 [Electronic resource]. – Mode of access: https://www.broadinstitute.org/gatk/index.php. – Date of access: 22.01.2017.
ANNOVAR [Electronic resource]. – Mode of access: http://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/. – Date of access: 25.01.2017.
ClinVar [Electronic resource]. – Mode of access: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/. – Date of access: 01.02.2017.
HSF [Electronic resource]. – Mode of access: http://www.umd.be/HSF3/HSF.html. – Date of access: 01.02.2017.
MaxEntScan [Electronic resource]. – Mode of access: http://genes.mit.edu/burgelab/maxent/Xmaxentscan_scoreseq. html. – Date of access: 01.02.2017.
NetGene2 [Electronic resource]. – Mode of access: http://www.cbs.dtu.dk/services/NetGene2/. – Date of access: 01.02.2017.
NNSPlice [Electronic resource]. – Mode of access: http://www.fruitfly.org/seq_tools/splice.html. – Date of access: 01.02.2017.
SplicePort [Electronic resource]. – Mode of access: http://spliceport.cbcb.umd.edu/. – Date of access: 01.02.2017.
OMIM [Electronic resource]. – Mode of access: https://www.omim.org/. – Date of access: 01.02.2017.
The c.65-2A/G splice site mutation is associated with a mild phenotype in Danon disease due to the transcription of normal LAMP2 mRNA / H. Cetin [et al.] // Clin. Genet. – 2016. – Vol. 90, N 4. – P. 366–371. doi.org/10.1111/cge.12724
 
Rights Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access).
Авторы, публикующие в данном журнале, соглашаются со следующим:Авторы сохраняют за собой авторские права на работу и предоставляют журналу право первой публикации работы на условиях лицензии Creative Commons Attribution License, которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы сохраняют право заключать отдельные контрактные договорённости, касающиеся не-эксклюзивного распространения версии работы в опубликованном здесь виде (например, размещение ее в институтском хранилище, публикацию в книге), со ссылкой на ее оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (См. The Effect of Open Access).